Seminario RIESGOONLINE

Me dirijo a Uds a fin de invitarlos a asistir a un nuevo seminario de divulgación del Biosience data Mining Group (www.bdmg.com.ar). En este caso disertará la empresa RIESGOONLINE, especializada en el análisis del mercado financiero y crediticio. La misma presentará su plataforma para el soporte a la toma de decisiones, centrándose en el tipo de datos que utiliza, las fuentes y la presentación de reportes para el soporte a la toma de decisiones. Lugar: Facultad de Ingeniería, Campus Universitario de la Universidad Católica de Córdoba. Fecha: miércoles 17 de junio, 16 Hrs.

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Comparación de análisis funcional SEA vs. GSEA.

Resumen: Al obtener niveles de expresión de genes (mediante RNA-Seq ó microarrays), es de gran utilidad identificar qué funciones biológicas, moleculares, vías metabólicas se encuentran modificadas (enriquecidas) por estos genes.Esta tarea se lleva a cabo mediante diversas herramientas que en conjunto con bases de datos que contienen información funcional a nivel de genes, realizan análisis estadístico/computacionales para determinar dichas funciones enriquecidas.Existen dos categorías dentro de estas herramientas, las cuales analizaremos: SEA (Singular Enrichment Analysis) y GSEA (Gene Set Enrichment Analysis).En este seminario se presentará el análisis hecho sobre un conjunto de datos tanto para metodologías GSEA (GSEA-p, Gage, Piano), como SEA (GoStat, DAVID). Con el fin de comparar qué términos se encuentran enriquecidos para cada herramienta utilizada.  Disertante: Lic. Juan Cruz Rodriguez Lugar: Laboratorio del Grupo de Minería de Datos en Biociencias, 1er piso Facultad de Ingeniería, Univ. Cat. de Córdoba Día y horario: 06 de mayo de 2014, 10:00 a.m. 

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Firmas moleculares en cáncer de mama

Resumen: Cuandos se habla de cáncer de mama, en realidad se está englobando a un grupo de enfermedades que afectan al seno y que tienen diferentes mecanismos biológicos subyacentes y diferentes respuestas a la terapia. Durante los últimos 15 años se han realizado grandes esfuerzos por caracterizar estos subtipos a nivel molecular y predecir la sobrevida de las pacientes afectadas. Para esto se busca encontrar un conjunto minimal de genes con capacidad predictiva, lo que se conoce como “firma molecular”. En este seminario se realizará una reseña de las firmas moleculares que se presentan en la literatura, la manera de generar una nueva firma molecular y los desafíos pendientes. Disertante: Lic. Germán González Lugar: Laboratorio del Grupo de Minería de Datos en Biociencias, 1er piso Facultad de Ingeniería, Univ. Cat. de Córdoba Dia y horario: 29 de abril de 2014

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Aplicación de un Standard Operating Protocol sobre un experimento de RNA-seq.

Resumen: El análisis de datos de RNA-seq implica, en general, la identificación de genes de manera tal de evaluar condiciones experimentales en término de expresión. Este análisis utiliza millones de lecturas de fragmentos de ADNc producidas por una máquina de secuenciación de alto rendimiento. La gran cantidad de datos generados por estos equipos es procesada en varios pasos, los cuales deben ser individualmente considerados y controlados. Si bien la técnica es revolucionaria, aun no es muy estable. Consecuentemente, existen fuentes de variación como efectos técnicos y aleatorios que deben ser tenidos en cuenta. De esta manera, será posible detectar y reducir el sesgo que producen dichos efectos sobre los resultados. En el presente seminario se presentará un standard operating protocol (SOP) para análisis de  datos RNA_seq. Este SOP no solo tiene como fin  hacer un análisis de expresión diferencial y/o análisis funcional, sino también evaluar cuidadosamente cada paso que involucran dichos análisis. La metodología aplicada se basa en inspección y exploración de los resultados, y se encuentra además enriquecida por la integración de  diferentes bases de datos para realizar la … Continue reading

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Curso de Posgrado: Introducción a la Minería de Datos con Aplicaciones

Este curso aborda los procesos fundamentales en el proceso de extracción de conocimiento en grandes volúmenes de datos mediante la utilización de metodologías provenientes de la inteligencia artificial, aprendizaje maquinal, estadística y visualización. Los alumnos se introducen en los principios y pasos requeridos para llevar una tarea de descubrimiento de conocimiento en forma paulatina, desarrollando algoritmos y entendiendo su funcionamiento en pos de interpretar más eficientemente los resultados. El curso está basado en la utilización del lenguaje R (www.r-project.org) donde se implementarán las distintas metodologías analíticas. El alumno aprenderá los conceptos de programación y de cálculo paralelo para análisis de datos y extracción de conocimiento. Se abordan conceptos como “Descubrimiento de Conocimiento en Bases de Datos”, “Reconocimiento de patrones”, “Big Data”, “Inteligencia de Negocios”, “visualización y exploración de datos”, etc. Con aplicaciones en diversas áreas como los Negocios, la Medicina, la Biotecnología y la Bioinformática. Descripción breve de la forma de dictado: El curso consta de clases teóricas y prácticas. Las mismas están organizadas en forma tal que el desarrollo de los conceptos teóricos precede a la aplicación práctica. Se … Continue reading

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Aplicación Novedosa de Métodos Estadísticos Como Herramienta Para Valorar la Rehabilitación de Pacientes Post-Cirugía de Ligamento Cruzado Anterior

Fecha: Miércoles 17 a las 11:00 hs. Lugar: Laboratorio del Grupo de Minería de Datos en Biociencias, Facultad de Ingeniería, Universidad Católica de Córdoba. Disertante: Bioing. Gabriela Merino (CONICET-UCC) Resumen: El ligamento cruzado anterior (LCA) es responsable de estabilizar la rodilla y limitar movimientos excesivos de rotación y extensión de la misma, influyendo en la cinemática de la rodilla normal. Por tal motivo, la deficiencia o lesión del LCA no solo produce episodios de inestabilidad sino también una alteración de la biomecánica articular. El proceso de rehabilitación del ligamento reconstruido es crítico para que el retorno a la actividad (especialmente a la actividad deportiva) sea exitoso. Una rehabilitación incompleta luego de una lesión de LCA, por ejemplo un prematuro retorno a la actividad, es un factor causal en la recurrencia de lesiones. Por lo cual, resulta fundamental e indispensable contar con conocimientos y herramientas sólidas que contribuyan a la determinación del progreso de la rehabilitación para cada paciente. Entre las mediciones propuestas, se destaca la valoración de la recuperación muscular. Una alternativa viable para la valoración de la actividad muscular … Continue reading

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Inteligencia artificial en ciencia y tecnología

En esta charla presentaremos dos proyectos que emplean técnicas de inteligencia artificial para resolver desafíos científicos y de ingeniería. Discutiremos cheap cialis online el desarrollo de cada trabajo y haremos hincapié en el uso generic viagra online de herramientas similares para objetivos sumamente diferentes: por un lado responder una pregunta de ciencia básica, y por el otro, generar recomendaciones para marketing personalizado. Disertante: Diego Maniloff es el arquitecto buy cialis online without a prescription del sistema de recomendación de Unata Inc. (unata.com), una startup canadiense que propone digitalizar los programas de lealtad. Luego de finalizar su maestría, trabajo como investigador en el Senseable City Lab del Instituto de Tecnología de Massachusetts (mit.edu/~d_m). Antes de MIT, Diego fue becario Fulbright en la Universidad de Illinois, dentro del laboratorio de Inteligencia Artificial (dali.ai.uic.edu). Diego es egresado de ingeniería en telecomunicaciones de la Universidad Blas Pascal. Fecha y lugar: 8 de noviembre a las 18.00 hrs en el lab del Grupo de Minería de Datos en Biociencias (Facultad de Ingeniería, Universidad Católica de Córdoba) Ver Fac de Ingenieria – UCC en un mapa más … Continue reading

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Investigations on the normalization of user-generated text

Disertante: Laura Alonso Alemany (PhD) (CV) Fecha: Jueves 13 de Septiembre de 2012 Lugar: Lab BioScience Data Mining Group, Fac. de Ingeniería, Universidad Catolica de Cordoba On-line: via hangout (contactarse con elmerfer at gmail com ) We present work in progress on word normalization for user-generated content. First, we show that normalization plays a crucial role in  the performance of chep viagra an information extraction (IE) system oriented to user-generated short texts. We evaluate a proof of concept of the IE  system on a corpus of on-line classified ads in Spanish, and we cialis show  that normalization has a big impact on the performance of subsequent  processing layers. Then, we investigate on the performance of  different normalization strategies based online canadian pharmacy on string edit  distances. We evaluate the impact of different search strategies and  learning strategies to adapt a standard string edit distance to the  phenomena observed in a given corpus. Finally, we propose a  semi-supervised approach to normalization based on  bootstraping. This approach is envisaged to cope with the rapidly  changing language of user-generated texts in a tight, probably  on-line, … Continue reading

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Data mining en medios de comunicación y redes sociales

Disertante: Lic. generic cialis PabloVerdenelli [infoxel] Lugar vendita cialis generico y Fecha: best way to check credit score Laboratorio de Computación, Sala B, Fac. de Ingeniería, Universidad Católica de Córdoba, 5 de junio de 2012, 16 Horas

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Imágenes modeladas con Distribuciones de Gibbs-Markov, Estimación e Interpretación de Parámetros, Simulación y ¿Programación en paralelo?

Disertante: Mg. Valeria Rulloni [CV] Lugar y fecha: Laboratorio de Computación, Sala B, Fac. de Ingeniería, Universidad Católica de Córdoba, 14 de junio de 2012, 11 horas Resumen: El modelado estadístico de imágenes es una herramienta muy valiosa debido al creciente interés en la utilización de imágenes para el desarrollo de diversas áreas del conocimiento. La ventaja de esta herramienta es muy apreciada pues favorece la extracción de la información que contienen las imágenes. Esta extracción de información, junto al acondicionamiento (mejoramiento, restauración, etc) de las imágenes es lo que llamamos Procesamiento de Imágenes. El procesado de imágenes puede encararse desde diversas disciplinas, el abordaje elegido es el modelado estadístico mediante Campos Gibbs-Markov, los cuales contemplan la falta de independencia entre píxeles y circunscriben esta falta de independencia sólo a los píxeles cercanos. Desde la Física Estadística, el modelo de ferromagnetismo presentado por Ising en su tesis doctoral comprare viagra (1925) sentó las bases de la teoría de los Campos Aleatorios, en donde partículas fijas en una grilla interactúan entre si y cada una se asocia con un valor de … Continue reading

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